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L'approche de Son laboratoire pour l'étude du phénomène général des interactions protéine-nucléotide est de synthétiser de nouveaux analogues de nucléotides qui sont fluorescents ou photo-actif, ou les deux. Les analogues sont alors utilisés pour étudier les diverses interactions qui règule l'activité de l'enzyme. Les analogues utilisés peuvent être des modifications de nucléotides connus sous le noms d'Adénosine triphosphate, Adénosine monophosphate cyclique, Guanosine triphosphate, dUTP diphosphatase et Nicotinamide adénine dinucléotide.
 
L'approche de Son laboratoire pour l'étude du phénomène général des interactions protéine-nucléotide est de synthétiser de nouveaux analogues de nucléotides qui sont fluorescents ou photo-actif, ou les deux. Les analogues sont alors utilisés pour étudier les diverses interactions qui règule l'activité de l'enzyme. Les analogues utilisés peuvent être des modifications de nucléotides connus sous le noms d'Adénosine triphosphate, Adénosine monophosphate cyclique, Guanosine triphosphate, dUTP diphosphatase et Nicotinamide adénine dinucléotide.
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L'une des études les plus connues d'Haley était celle dans lequel il a montré que les taux de Glutamine synthétase étaient considérablement plus élevés dans le liquide céphalo-rachidien des patients atteints de la maladie d'Alzheimer que dans celui des personnes non-atteintes.<refhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1361232 Etude "Detection of glutamine synthetase in the cerebrospinal fluid of Alzheimer diseased patients: a potential diagnostic biochemical marker". Auteurs :Gunnersen D, Haley B. Publiée le 15 décembre 1992 dans Proc Natl Acad Sci U S A.</ref><ref>http://www.nytimes.com/1992/12/15/news/a-possible-alzheimer-marker-is-found.html Article publié dans The Time le 15 décembre 1992, intitulé "Possible Alzheimer Marker Is Found" (On a trouvé un marqueur possible de l'Alzheimer)</ref>
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L'une des études les plus connues d'Haley était celle dans laquelle il a montré que les taux de Glutamine synthétase étaient considérablement plus élevés dans le liquide céphalo-rachidien des patients atteints de la maladie d'Alzheimer que dans celui des personnes non-atteintes.<refhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1361232 Etude "Detection of glutamine synthetase in the cerebrospinal fluid of Alzheimer diseased patients: a potential diagnostic biochemical marker". Auteurs :Gunnersen D, Haley B. Publiée le 15 décembre 1992 dans Proc Natl Acad Sci U S A.</ref><ref>http://www.nytimes.com/1992/12/15/news/a-possible-alzheimer-marker-is-found.html Article publié dans The Time le 15 décembre 1992, intitulé "Possible Alzheimer Marker Is Found" (On a trouvé un marqueur possible de l'Alzheimer)</ref>
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== Recherches sur le mercure ==
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Haley a témoigné à la Food and Drug Administration en ce qui concerne la vapeur de mercure des amalgames dentaires et les vaccins contenants du thimérosal. Haley était l'un des premiers chercheurs à avancer que le Thimérosal dans des vaccins était l'agent toxique le plus probable impliqué dans le syndrome de Guerre du Golfe et les troubles de spectre autistique.
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Haley a mené des études qui suggèrent que de faibles taux de mercure sont capables de contribuer à certaines maladies neurologiques comme l'autisme et la maladie d'Alzheimer, et il a observé que l'exposition de rats de laboratoire à de faibles taux de vapeur de mercure provoque une forte augmentation des teneurs de mercure dans le cerveau des rats, ainsi qu'une diminution marquée dans le cerveau photomarquage de tubiline, comme cela a été constaté dans les cerveaux de patients atteints de la maladie d'Alzheimer.
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En utilisant l'analyse des cheveux de naissance, Haley a apporté la preuve que les enfants diagnostiqués autistes excrètent moins de mercure. Son hypothèse est qu'ils forment un sous-ensemble qui est distinct de la population à excrétion réduite de mercure, relative au rôle controversé et non prouvé du thiomersal dans l'étiologie d'autisme.
    
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