Seit 1988 streiten Rössler und seine Ehefrau mit der Universität Tübingen und dem Wissenschaftsministerium Baden-Württemberg. Ursache dazu sind Meinungsverschiedenheiten bezüglich des Umfangs und Inhalts der akademischen Lehrverpflichtungen. Im Zuge der Auseindersetzungen kam es Verurteilungen wegen Hausfriedensbruch und Sachbeschädigung.
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Seit 1988 streiten Rössler und seine Ehefrau mit der Universität Tübingen und dem Wissenschaftsministerium Baden-Württemberg. Ursache dazu sind Meinungsverschiedenheiten bezüglich des Umfangs und Inhalts der akademischen Lehrverpflichtungen. Rössler und seine Frau verweigerten zeitweilig den Dienst an der Universität. Im Zuge der Auseindersetzungen kam es Verurteilungen wegen Hausfriedensbruch und Sachbeschädigung. Als er disziplinarischen MAssnahmen ausgesetzt war, verglich er seine Lage mit dem Leid der im Holocaust vernichteten europäischen Juden. Er besprühte im August 2001 die Aula der Universität Tübingen mit den Buchstaben P. U. T. (''Pogrom Universität Tübingen'') und heftete sich einen gelben Judenstern an die Brust.<ref>http://www.relativ-kritisch.net/blog/allgemein/otto-e-rossler-entgleisungen-zum-9-november</ref>